华南农业年夜学传授王艇团队、福建农林年夜学传授刘仲健团队和中山年夜学传授苏应娟团队在国度天然科学基金、广东省根本与利用根本研究基金等项目标帮助下，基在统计基因组学阐发揭露了麻栗坡兜兰简单反复序列的表达调控要害基序。相干功效近日颁发在《进步前辈科学》（Advanced Science）。

简单反复序列（SSR）在原核和真核生物的基因组普遍存在，能驱动物种快速产生遗传变异、基因表达进化和情况顺应。位在基因内的SSR更是可被用作调理基因表达和心理代谢进程的“旋钮”，进而激发表型改变。可是，对这些具基因表达调控功能的SSR（开博体育eSSR），它们的基序构成、拷贝数和在基因中的散布式样对基因表达发生的效应，今朝还所知较少。

该研究对麻栗坡兜兰转录组的SSR进行了系统的统计基因组学阐发，证实eSSR基序类型与基因表达程度存在联系关系，判定出9个表达调控基序（expMotif）和11个基序-转录区组合；发现基序类型-转录区组合是决议SSR所起表达调控感化的要害身分，并提出领会释eSSR感化机制的模子；同时，对eSSR散布与MYB、F-box和TCP家族旁系同源基因的表达程度的相干性也进行了尝试验证，成果注解eSSR反复单元的突变可致使地点基因的表达产生显著改变。

该研究为熟悉反复序列对兰科植物基因组的顺应性进化供给了新看法，所成立起的eSSR高通量统计基因组学阐发框架也可用在其他植物的研究。

相干论文信息：https://doi.org/10.1002/advs.202304848

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