近日，中国科学手艺年夜学物理系汪骞课题组和上海科技年夜学免疫化学研究所白芳课题组合作，提出了卵白质变构路径猜测的深度进修模子。该功效在线颁发在《进步前辈科学》。

深度进修模子PATHpre成立流程。中国科年夜供图

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最近几年来，以AlphaFold为代表的深度进修模子在猜测卵白质的静态布局方面获得了庞大成功。但是，卵白质的功能取决在其动力学特征。研究人员今朝正在积极摸索其他深度进修算法，旨在猜测卵白质的构象转变等动态行动。开辟这类模子的首要挑战之一，在在描写构象改变的动力学数据严重不足。

为领会决该问题，作者连系物理束缚的粗粒度份子动力学模子与加强采样方式成立了高效摹拟卵白变构的计较框架，并利用此框架摹拟了2635个卵白质在双稳态之间的构象改变。该工作收集了每一个卵白在其变构路径上的布局信息，从而成立了首个年夜范围的卵白质动态数据库。

在此根本上，作者开辟了一个通用的深度进修模子PATHpre，可以或许猜测卵白质在双稳态之间的变构路径。该模子在分歧序列长度的卵白质（规模从44到704个氨基酸）上均揭示了杰出的猜测能力，并合用在包罗变形卵白在内的多类变构系统。研究人员在多个系统中展现了猜测成果与尝试或摹拟数据的一致性，并操纵该模子发现了肌球卵白的变构调控新机制。

相干论文信息：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/advs.202400884

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