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开博-科学家绘制出燕麦野生种基因密码图谱—新闻—科学网

发布日期:2024-07-09 作者:开博

近日,中国科学院华南植物园副研究员刘青团队与英国莱斯特年夜学传授John Seymour Heslop Harrison合作,采取基因组学手艺,组装燕麦野生种基因组序列,展开比力基因组学研究,绘制出燕麦野生种基因暗码图谱。相干研究功效颁发在《科学数据》(Scientific Data)和《BMC植物生物学》(BMC Plant Biology)。

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燕麦野生种基因暗码图谱。刘青供图

燕麦曾是土耳其安纳托利亚地域小麦田中的杂草,在三千多年前被驯化,其基因组遗传多样性丰硕,表示为基因组较年夜(12.6 Gb, 6x),具有近似马赛克的染色体镶嵌布局,致使燕麦染色体布局变异的进化事务知之甚少,而其二倍体野生种基因数目类似,是燕麦抗逆、顺应性状的基因宝库。

该研究经由过程基因组测序和组装,取得高质量的长颖燕麦(Avena longiglumis,2n= 2x= 14) 基因组3.85 Gb,注释40,845个卵白质编码基因,并取得耐盐的转录组数据,为燕麦耐盐基因的开辟带来新启迪。

比力基因组学研究发现,燕麦属野生种——长颖燕麦和异颖燕麦(A. eriantha,2n= 2x = 14) 的共线性区域高度守旧;二倍体野生种染色体易位产生在近端粒50 Mb的区域,六倍开博体育体燕麦也存在近似的基因组间易位;肯定燕麦属产生过post-rho全基因组复制事务。

该研究重构禾本科早熟禾亚科的进化史,为燕麦基因组辅助育种奠基主要的理论根本,将鞭策燕麦野生种质资本利用。其研究成果加深人们对燕麦基因组发源的熟悉。

上述研究获得国度天然科学基金、广东省根本与利用根本研究基金、中国科学院华南植物园海外知论理学者项目标帮助。

相干论文信息:https://doi.org/10.1038/s41597-024-03248-6

https://doi.org/10.1186/s12870-023-04644-7

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