近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员唐兵士与浙江年夜学研究员杨兵、北京航空航天年夜学副传授刘超团队合作，在国度天然科学基金、国度重点研发打算等项目标撑持下，开辟出一种新型氟磺酸类可富集化学交联的非自然氨基酸并在活细胞中研究卵白质直接彼此感化。相干功效颁发在《天然-通信》。

卵白质-卵白质彼此感化判定是卵白质功能研究的主要步调，在活细胞华夏位判定直接彼此感化卵白对生物医药研究具有主要意义。基在临近触发反映的化学交联非自然氨基酸可以捕捉弱感化力和瞬时卵白质彼此感化，已被开辟用在原位判定活细胞中的卵白质彼此感化。基在质谱的交联肽段解析可以或许提高互作卵白判定的特异性、肯定卵白彼此感化界面。但是，因为卵白质样品和质谱数据解析进程的复杂性，对卵白质化学交联后的交联产品进行高通量判定具有挑战性。在卵白质样品进行质谱阐发前，对交联肽段进行富集是提高判定效力的有用策略。

?

新型含氟磺酸基团的可富集化学交联剂eFSY研究卵白质彼此感化时，判定交联肽段的流程图（a），交联肽段的碎裂纪律（b）和交联判定软件AixUaa的开辟流程（c）。研究团队供图

该研究中，研究人员开辟了一种基在化学基团氟磺酸的化学交联非自然氨基酸，便可富集的氟磺酸-L-酪氨酸（eFSY）。他们操纵暗码子扩大手艺可以在卵白质中特定位置插入具有潜伏生物反映性的非自然氨基酸eFSY，eFSY中氟磺酸经由过程基在临近触发反映引诱的硫-开博体育氟互换点击反映与彼此感化卵白中的酪氨酸、组氨酸或赖氨酸产生共价交联。eFSY携带的炔基基团可以经由过程铜催化叠氮化物-炔环加成点击化学反映链接生物素，随后就可以实现交联肽段的富集，从而晋升判定交联肽段的效力。另外，该研究发现氟磺酸基团介导的交联产品在质谱中的夹杂性碎裂纪律，其与组氨酸和赖氨酸交联发生的磺酸酰胺键会在质谱中产生断裂，与酪氨酸交联后构成的磺酸酰胺键却不会断裂。

为更好地利用该纪律，该研究进一步开辟了交联判定软件AixUaa。AixUaa可同时兼容并辨别碎裂与不成碎裂两种模式，实现了交联肽段和位点的切确匹配，晋升了交联肽段的判定数目。利用此流程，研究人员别离在年夜肠杆菌和哺乳动物活细胞中系统性地判定了硫氧还卵白1和硒卵白M的直接彼此感化卵白组，验证了该方式的有用性。

该研究开辟的基在氟磺酸基团的可富集化学交联非自然氨基酸eFSY和交联判定软件AixUaa显著晋升了在活细胞中判定直接彼此感化卵白中化学交联肽段的效力，降服了以往化学交联剂在判定卵白质彼此感化卵白组的一些不足，有望利用在更普遍的卵白质彼此感化研究。

相干论文信息：https://doi.org/10.1038/s41467-024-49517-1

版权声明：凡本网注明“来历：中国科学报、科学网、科学新闻杂志”的所有作品，网站转载，请在正文上方注明来历和作者，且不得对内容作本色性改动；微信公家号、头条号等新媒体平台，转载请联系授权。邮箱：shouquan@stimes.cn。

上一篇:开博-重庆大学深入实施“头部企业”工程—新闻—科学网 下一篇:开博-提高大语言模型可信度，新方法助生成式AI破除“幻觉”—新闻—科学网