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开博-新平台可绘制亚细胞精度的组织3D图—新闻—科学网

发布日期:2024-08-23 作者:开博

Open-ST平台可以操纵一系列2D图象,将其重建为3D图象。

图片来历:拉杰斯基尝试室网站

科技日报北京6月26日电(记者张佳欣)德国马克斯 德尔布吕克中间尼古拉斯 拉杰斯基尝试室团队开辟出一种名为Open-ST的空间转录平台,能以三维(3D)体例重建患者组织细胞内的基因表达,并以亚细胞精度绘制出组织样本的份子图谱。相干论文颁发在新一期《细胞》杂志上。

转录组学是研究细胞或细胞群中基因表达的学科,凡是不包罗空间信息,而空间转录组学则能丈量组织样本中RNA在空间中的表达。Open-ST平台供给了一种经济高效、高分辩率、易在利用的方式,既可以拍摄样本的组织形态,也能拍摄组织切片的空间转录组学信息。该平台可以操纵一系列2D图象,将其重建为3D“虚拟立体组织”。

在尝试中,研究人员操纵来自头颈癌患者健康和转移淋凑趣的样本,成功辨认出免疫、开博体育间质和肿瘤细胞群的多样性特点。这些细胞群是环绕原发肿瘤内的通信热门组织起来的,但这类组织在转移瘤中被粉碎了。

Open-ST平台按照癌症组织样本绘制的图象,凸起显示了3D肿瘤或淋凑趣鸿沟处的潜伏生物标识表记标帜,这些标识表记标帜可能成为新的药物靶点。而这些潜伏生物标识表记标帜在2D阐发中是不成见的。

Open-ST平台为研究供给了史无前例的精度。例如,人们可以定位到3D图象中的任何位置,阐发单个细胞内部的份子机制,或健康细胞和癌细胞之间的鸿沟。这有助领会癌细胞若何与四周情况互动,为摸索癌细胞与免疫系统的彼此感化供给了新视角。另外,该平台其实不局限在癌症研究,还可用在摸索多种类型的组织和生物体。

今朝,研究人员已将全部尝试和计较工作流程免费开放,以便普遍利用。

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